Capítulo 14 referências bibliográficas

Aqui começamos a fazer a transição de um simples relatório a um potencial artigo… Vamos incluir bibliografia!

Qualquer gerenciador de bibliografias (Zotero, Mendeley, etc) possibilita extrair os artigos no formato .bib. Se vocês selecionarem os artigos/livros que vão usar e exportá-los como .bib e abri-los em um editor do texto5, poderá ver algo assim:

@article{Akcakaya2009,
abstract = {The World Conservation Union (IUCN) defined a set of categories for conservation status sup- ported by decision rules based on thresholds of parameters such as distributional range, population size, pop- ulation history, and risk of extinction. [...] We propose a method of dealing with uncertainty that can be applied to the current IUCN criteria without altering the rules, thresholds, or intent of these criteria. Our method propagates the uncertainty in the input parameters and assigns the evaluated spe- cies either to a single category (as the current criteria do) or to a range of plausible categories, depending on the nature and extent of uncertainties.},
author = {Akcakaya, H Resit and Ferson, Scott and Burgman, Mark a and Keith, David a and Georgina, M and Todd, Charles R},
doi = {10.1046/j.1523-1739.2000.99125.x},
file = {:home/felipe/Documentos/ConsistentIUCN.pdf:pdf},
issn = {0888-8892},
journal = {Conservation biology},
keywords = {Artigo pos,Revisao{\_}Intro},
mendeley-tags = {Artigo pos,Revisao{\_}Intro},
number = {4},
pages = {1001--1013},
title = {{Making Consistent IUCN Classifications under Uncertainty}},
url = {http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1046/j.1523-1739.2000.99125.x/full},
volume = {14},
year = {2009}
}

Uma vez que tenhamos exportado os artigos a serem usados para o formato .bib e com o arquivo na mesma pasta onde estamos trabalhando nosso texto,6 precisaremos informar ao Markdown que vamos usar a opção de bibliografia e qual será o arquivo .bib a ser usado. Para isso, adicionaremos à confirguração do RMarkdown a seguinte linha: bibliography: Referencias.bib.

Repare como está a configuração deste documento que vc está lendo:

---
title: "Relatorios com RMarkdown"
date: 12/02/2019
output:
  pdf_document: default
  word_document: default
bibliography: Referencias.bib
---

Neste caso estou dizendo que o arquivo com as referências bibliográficas estão no arquivo “Referencias.bib”.

Tendo feito isso, agora já posso fazer as citações, da seguinte forma:
[@Akcakaya2009] = (Akcakaya et al. 2009)
ou
@Akcakaya2009 = Akcakaya et al. (2009)
Caso queiramos adicionar mais refencias:
[@Akcakaya2009, @Akcakaya2009] = (Akcakaya et al. 2009, @Akcakaya2009)
ou
@Akcakaya2009, @Akcakaya2009 = Akcakaya et al. (2009), Akcakaya et al. (2009)

Legal. Até agora, já adicionamos nossa base de dados de referências, fizemos a citação. Mas como fica a bibliografia?

Basta adicionarmos um capitulo ## References (com qualque níve de hierarquia) e pronto! O RMarkdown já entenderá que nessa seção deverão constar todos e apenas aquelas referências que constan em nosso .bib que tenham sido usadas. E por mais que usemos mais de uma citação para um mesmo artigo, só aparecerá uma referencia…

E aí: Vai querer continuar usando o Word?

Outra coisa, pelo fato de o .bib se um doc de texto, o mesmo pode ser versionado. Outros colaboradores poderão adicionar novas referências e fazer citações e tudo será controlado por versionamento…

A qualidade da referencia se derá conforme a qualidade dos dados disponíveis e organizados no .bib. Ou seja, se seu gerenciador de referências não foi capaz de identificar algumas informações do artigo, os mesmos estarão ausentes.

14.1 Adicionando autor, abstract e afiliações

Para adicionar autor e abstract teremos que adicionar à área de configuração do RMarkdown:

author:
- Felipe S. M. Barros
abstract: |
  Aqui vai o abstract

Você pode adicionar quantos autores quiser;

FALTA VER COMO INFORMAR UNIVERSIDADE DOS AUTORES

References

Akcakaya, H Resit, Scott Ferson, Mark a Burgman, David a Keith, M Georgina, and Charles R Todd. 2009. “Making Consistent IUCN Classifications under Uncertainty.” Conservation Biology 14 (4): 1001–13. https://doi.org/10.1046/j.1523-1739.2000.99125.x.


  1. editor de texto não é a mesma coisa que Word! Abra com um notepad

  2. Caso o arquivo esteja em uma pasta diferentes, será necessário informar o cominho à pasta